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分子探针与表观遗传学研究好文分享：alkbh5 介导的 m6A 对 circCCDC134 修饰通过增强 HIF1A 转录促进宫颈癌转移 (IF = 12.658)
人阅读 发布时间：2022-09-19 15:52
ALKBH5-mediated m6A modifcation of circCCDC134 facilitates cervical cancer metastasis by enhancing HIF1A transcription《Journal of Experimental & Clinical Cancer Research》(IF = 12.658)
背景：
转移是子宫颈癌 (CC) 死亡的主要原因。环状 rna 已被证明在癌中的生物学中起着至关重要的作用。然而，环状 rna 在宫颈癌转移中的表达和功能尚不清楚。
方法：
在本研究中，我们鉴定了一种具有 n6-甲基腺苷 (m6A) 修饰的 circccdc134，通过 circRNA-Seq 和 qPCR，其在 CC 组织中的表达增加。
CircCCDC134 在 CC 中的上调是通过 alkbh5 介导的 m6A 修饰来调节的，这以 ythdf2 依赖的方式增强了其稳定性。
功能实验表明，circCCDC134 在体内外均能增强肿瘤的增殖和转移。
为了全面鉴定 RNA 结合蛋白，我们使用 circRNA 下拉和质谱 (ChIRP-MS)、染色质免疫沉淀-seq(ChIp-seq)、RNA 结合蛋白免疫沉淀 (RIP) 和荧光素酶报告分析来进行机制研究。
结果：
结果显示，circCCDC134 在细胞核中招募 p65，并作为 miR-503-5p 海绵调节细胞质中 MYB 的表达，最终刺激 HIF1A 转录，促进 CC 的生长和转移。
结论：
提示 circCCDC134 是一个重要的治疗靶点，为探索 circcCCDC134 在 CC 中的致癌机制提供了新的调控模型。
m6A 修饰在环状 rna 的转录后调控和生物发生中起着关键作用，分析发现 circCCDC134 有许多 m6A 修饰位点。
为了进一步探索这一点，研究团队用 TRAP、RIP、meRIP 等技术进行分子调控机制研究。
TRAP 分析和质谱分析来筛选 circccdc134 相互作用的蛋白和全面识别 RNA 结合蛋白；circCCDC134 与多种蛋白合作，包括 ALKBH5 和 YTHDF2；ALKBH5 蛋白和 YTHDF2 蛋白可以与 circCCDC134-MS2 结合;circRNA 下拉分析结果显示，miR-503-5p 可以特异性地结合 circCCDC134。
RIP 检测结果表明，ALKBH5 和 YTHDF2 都能与 circCCDC134 相互作用；运用 m6A RNA 免疫沉淀 (MeRIP) 定量 circCCDC134 的 m6A 水平，m6A qPCR 检测 circCCDC134 的 m6A 甲基化状态；同时 RIP 检测也表明，与 IgG 组相比，Ago2 组中 circCCDC134 和 miR-503-5p 的富集增加。
研究团队证明了 circCCDC134 不仅通过 ceRNA 机制发挥功能，而且通过招募 p65 发挥作用，ircCCDC134 将 p65 招募到细胞核，并作为 miR-503-5p 海绵调节细胞质中 MYB 的表达，最终刺激 HIF1A 转录，促进 CC 的生长和转移。
强调了 m6A 去甲基化酶在 circCCDC134 表达中的吸引力价值，以及 circCCDC134 在增强细胞质和细胞核中 HIF1A 转录中的关键作用。
作者使用伯信生物明星产品 TRAP 和 RIP 以及 MeRIP 三款试剂盒进行了上述分子互作调控机制的研究。
原文链接：https://jeccr.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13046-022-02462-7
背景：
转移是子宫颈癌 (CC) 死亡的主要原因。环状 rna 已被证明在癌中的生物学中起着至关重要的作用。然而，环状 rna 在宫颈癌转移中的表达和功能尚不清楚。
方法：
在本研究中，我们鉴定了一种具有 n6-甲基腺苷 (m6A) 修饰的 circccdc134，通过 circRNA-Seq 和 qPCR，其在 CC 组织中的表达增加。
CircCCDC134 在 CC 中的上调是通过 alkbh5 介导的 m6A 修饰来调节的，这以 ythdf2 依赖的方式增强了其稳定性。
功能实验表明，circCCDC134 在体内外均能增强肿瘤的增殖和转移。
为了全面鉴定 RNA 结合蛋白，我们使用 circRNA 下拉和质谱 (ChIRP-MS)、染色质免疫沉淀-seq(ChIp-seq)、RNA 结合蛋白免疫沉淀 (RIP) 和荧光素酶报告分析来进行机制研究。
结果：
结果显示，circCCDC134 在细胞核中招募 p65，并作为 miR-503-5p 海绵调节细胞质中 MYB 的表达，最终刺激 HIF1A 转录，促进 CC 的生长和转移。
结论：
提示 circCCDC134 是一个重要的治疗靶点，为探索 circcCCDC134 在 CC 中的致癌机制提供了新的调控模型。
m6A 修饰在环状 rna 的转录后调控和生物发生中起着关键作用，分析发现 circCCDC134 有许多 m6A 修饰位点。
为了进一步探索这一点，研究团队用 TRAP、RIP、meRIP 等技术进行分子调控机制研究。
TRAP 分析和质谱分析来筛选 circccdc134 相互作用的蛋白和全面识别 RNA 结合蛋白；circCCDC134 与多种蛋白合作，包括 ALKBH5 和 YTHDF2；ALKBH5 蛋白和 YTHDF2 蛋白可以与 circCCDC134-MS2 结合;circRNA 下拉分析结果显示，miR-503-5p 可以特异性地结合 circCCDC134。
RIP 检测结果表明，ALKBH5 和 YTHDF2 都能与 circCCDC134 相互作用；运用 m6A RNA 免疫沉淀 (MeRIP) 定量 circCCDC134 的 m6A 水平，m6A qPCR 检测 circCCDC134 的 m6A 甲基化状态；同时 RIP 检测也表明，与 IgG 组相比，Ago2 组中 circCCDC134 和 miR-503-5p 的富集增加。
研究团队证明了 circCCDC134 不仅通过 ceRNA 机制发挥功能，而且通过招募 p65 发挥作用，ircCCDC134 将 p65 招募到细胞核，并作为 miR-503-5p 海绵调节细胞质中 MYB 的表达，最终刺激 HIF1A 转录，促进 CC 的生长和转移。
强调了 m6A 去甲基化酶在 circCCDC134 表达中的吸引力价值，以及 circCCDC134 在增强细胞质和细胞核中 HIF1A 转录中的关键作用。
作者使用伯信生物明星产品 TRAP 和 RIP 以及 MeRIP 三款试剂盒进行了上述分子互作调控机制的研究。
原文链接：https://jeccr.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13046-022-02462-7
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